MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016821	AAG	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335624
2	NC_016821	CAAG	2	8	1562	1569	50 %	0 %	25 %	25 %	381335624
3	NC_016821	GTCA	2	8	1591	1598	25 %	25 %	25 %	25 %	381335624
4	NC_016821	GGA	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	381335624
5	NC_016821	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335625
6	NC_016821	CAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335625
7	NC_016821	GAGAA	2	10	2178	2187	60 %	0 %	40 %	0 %	381335625
8	NC_016821	ATTA	2	8	2276	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	381335625
9	NC_016821	TTCA	2	8	2284	2291	25 %	50 %	0 %	25 %	381335625
10	NC_016821	TTCA	2	8	2407	2414	25 %	50 %	0 %	25 %	381335625
11	NC_016821	AGC	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335625
12	NC_016821	TTGG	2	8	2479	2486	0 %	50 %	50 %	0 %	381335625
13	NC_016821	CAG	3	9	2617	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335626
14	NC_016821	TAT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335626
15	NC_016821	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	381335626
16	NC_016821	A	6	6	3151	3156	100 %	0 %	0 %	0 %	381335627
17	NC_016821	CGT	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335627
18	NC_016821	A	7	7	3294	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	381335627
19	NC_016821	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	381335628
20	NC_016821	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
21	NC_016821	A	8	8	4652	4659	100 %	0 %	0 %	0 %	381335628
22	NC_016821	TTA	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335628
23	NC_016821	TGA	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
24	NC_016821	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335629
25	NC_016821	TAA	2	6	4809	4814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
26	NC_016821	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
27	NC_016821	TTA	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335629
28	NC_016821	AT	3	6	4926	4931	50 %	50 %	0 %	0 %	381335629
29	NC_016821	TAA	2	6	4942	4947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335629
30	NC_016821	AATA	2	8	4948	4955	75 %	25 %	0 %	0 %	381335629
31	NC_016821	AAG	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
32	NC_016821	TA	3	6	5147	5152	50 %	50 %	0 %	0 %	381335630
33	NC_016821	TC	3	6	5240	5245	0 %	50 %	0 %	50 %	381335630
34	NC_016821	AG	3	6	5278	5283	50 %	0 %	50 %	0 %	381335630
35	NC_016821	ATT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335630
36	NC_016821	GAAC	2	8	5338	5345	50 %	0 %	25 %	25 %	381335630
37	NC_016821	ACA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335630
38	NC_016821	TACA	2	8	5463	5470	50 %	25 %	0 %	25 %	381335630
39	NC_016821	GAA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335630
40	NC_016821	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335630
41	NC_016821	CTTA	2	8	5670	5677	25 %	50 %	0 %	25 %	381335631
42	NC_016821	TCA	3	9	5734	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
43	NC_016821	TAA	2	6	5752	5757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335631
44	NC_016821	TAT	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335631
45	NC_016821	TGTT	2	8	5796	5803	0 %	75 %	25 %	0 %	381335631
46	NC_016821	ATTTT	2	10	5813	5822	20 %	80 %	0 %	0 %	381335631
47	NC_016821	CTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
48	NC_016821	TAC	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335631
49	NC_016821	CAAG	2	8	5927	5934	50 %	0 %	25 %	25 %	381335631
50	NC_016821	AT	3	6	5935	5940	50 %	50 %	0 %	0 %	381335631
51	NC_016821	A	6	6	6047	6052	100 %	0 %	0 %	0 %	381335632
52	NC_016821	A	6	6	6058	6063	100 %	0 %	0 %	0 %	381335632
53	NC_016821	ATG	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
54	NC_016821	TATT	2	8	6128	6135	25 %	75 %	0 %	0 %	381335632
55	NC_016821	TGA	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
56	NC_016821	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335632
57	NC_016821	GAT	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
58	NC_016821	GAT	2	6	6319	6324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335632
59	NC_016821	GTAT	2	8	6350	6357	25 %	50 %	25 %	0 %	381335632
60	NC_016821	GATT	2	8	6965	6972	25 %	50 %	25 %	0 %	381335633
61	NC_016821	AATCT	2	10	6998	7007	40 %	40 %	0 %	20 %	381335633
62	NC_016821	GTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
63	NC_016821	T	6	6	7084	7089	0 %	100 %	0 %	0 %	381335633
64	NC_016821	TTTC	2	8	7244	7251	0 %	75 %	0 %	25 %	381335633
65	NC_016821	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335633
66	NC_016821	TTC	2	6	7351	7356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
67	NC_016821	GTC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335633
68	NC_016821	ATC	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
69	NC_016821	TTC	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
70	NC_016821	T	6	6	7552	7557	0 %	100 %	0 %	0 %	381335633
71	NC_016821	T	6	6	7581	7586	0 %	100 %	0 %	0 %	381335633
72	NC_016821	TAT	2	6	7619	7624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335633
73	NC_016821	GCA	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335633
74	NC_016821	T	6	6	7657	7662	0 %	100 %	0 %	0 %	381335633
75	NC_016821	CTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
76	NC_016821	ATC	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335633
77	NC_016821	TGG	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335633
78	NC_016821	A	6	6	7872	7877	100 %	0 %	0 %	0 %	381335633
79	NC_016821	TTC	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335633
80	NC_016821	ATC	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335634
81	NC_016821	AAT	2	6	8605	8610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335634
82	NC_016821	GAA	2	6	8672	8677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335634
83	NC_016821	AT	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	381335634
84	NC_016821	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335635
85	NC_016821	GAA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335635
86	NC_016821	TGG	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335635
87	NC_016821	TTAA	2	8	9750	9757	50 %	50 %	0 %	0 %	381335636
88	NC_016821	T	6	6	9855	9860	0 %	100 %	0 %	0 %	381335636
89	NC_016821	AATG	2	8	9877	9884	50 %	25 %	25 %	0 %	381335636
90	NC_016821	ATAA	2	8	9998	10005	75 %	25 %	0 %	0 %	381335636
91	NC_016821	TTG	2	6	10071	10076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335636
92	NC_016821	ATC	2	6	10122	10127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335636
93	NC_016821	ATA	2	6	10159	10164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
94	NC_016821	TTA	2	6	10213	10218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
95	NC_016821	AAT	2	6	10225	10230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335636
96	NC_016821	TTA	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335636
97	NC_016821	T	6	6	10262	10267	0 %	100 %	0 %	0 %	381335636
98	NC_016821	AACA	2	8	10851	10858	75 %	0 %	0 %	25 %	381335637
99	NC_016821	A	7	7	10884	10890	100 %	0 %	0 %	0 %	381335637
100	NC_016821	CAG	2	6	11006	11011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335637
101	NC_016821	ACC	2	6	11019	11024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335637
102	NC_016821	TGG	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
103	NC_016821	GTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
104	NC_016821	GCT	2	6	11281	11286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335637
105	NC_016821	ATG	2	6	11534	11539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335637
106	NC_016821	TTG	3	9	11540	11548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
107	NC_016821	AAG	2	6	11573	11578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381335637
108	NC_016821	GTG	2	6	11600	11605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335637
109	NC_016821	TTG	2	6	11737	11742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335637
110	NC_016821	TCA	2	6	11743	11748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335637
111	NC_016821	TTATT	2	10	11946	11955	20 %	80 %	0 %	0 %	381335638
112	NC_016821	TGC	2	6	11973	11978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
113	NC_016821	TGT	2	6	11994	11999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
114	NC_016821	A	6	6	12008	12013	100 %	0 %	0 %	0 %	381335638
115	NC_016821	CTG	2	6	12047	12052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335638
116	NC_016821	TAA	2	6	12066	12071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335638
117	NC_016821	CAG	2	6	12090	12095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
118	NC_016821	GTT	2	6	12130	12135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335638
119	NC_016821	TCTT	2	8	12149	12156	0 %	75 %	0 %	25 %	381335638
120	NC_016821	T	6	6	12181	12186	0 %	100 %	0 %	0 %	381335638
121	NC_016821	T	6	6	12306	12311	0 %	100 %	0 %	0 %	381335638
122	NC_016821	CTATTT	2	12	12335	12346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	381335638
123	NC_016821	CAG	2	6	12374	12379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335638
124	NC_016821	CCA	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335638
125	NC_016821	TAT	2	6	12471	12476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335638
126	NC_016821	ATC	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335638
127	NC_016821	CTT	2	6	12531	12536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335638
128	NC_016821	GGT	2	6	12544	12549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	381335638
129	NC_016821	ATT	3	9	12666	12674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335639
130	NC_016821	CAG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335639
131	NC_016821	TGA	2	6	12826	12831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335639
132	NC_016821	ACA	2	6	12875	12880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335639
133	NC_016821	TGC	2	6	12889	12894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335639
134	NC_016821	TGC	2	6	12898	12903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335639
135	NC_016821	CGA	2	6	12931	12936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335639
136	NC_016821	ACA	2	6	12943	12948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335639
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138	NC_016821	TTG	2	6	13008	13013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335639
139	NC_016821	ATT	2	6	13213	13218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335640
140	NC_016821	TGT	2	6	13249	13254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335640
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142	NC_016821	ATA	2	6	13359	13364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335640
143	NC_016821	TGC	2	6	13381	13386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335640
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146	NC_016821	GCTG	2	8	13535	13542	0 %	25 %	50 %	25 %	381335640
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148	NC_016821	AGTG	2	8	13642	13649	25 %	25 %	50 %	0 %	381335640
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150	NC_016821	TGA	2	6	13807	13812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335640
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154	NC_016821	GCTT	2	8	14186	14193	0 %	50 %	25 %	25 %	381335641
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156	NC_016821	TTG	2	6	14441	14446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335641
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174	NC_016821	ATT	2	6	15330	15335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335642
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259	NC_016821	CAA	2	6	21108	21113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335648
260	NC_016821	ATA	2	6	21181	21186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335648
261	NC_016821	ATC	2	6	21189	21194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
262	NC_016821	GTGTC	2	10	21329	21338	0 %	40 %	40 %	20 %	381335648
263	NC_016821	TGC	2	6	21346	21351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335648
264	NC_016821	A	6	6	21413	21418	100 %	0 %	0 %	0 %	381335648
265	NC_016821	T	6	6	21458	21463	0 %	100 %	0 %	0 %	381335648
266	NC_016821	ACG	2	6	21510	21515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335648
267	NC_016821	CAT	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
268	NC_016821	GGC	2	6	21589	21594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	381335648
269	NC_016821	GTAC	2	8	21607	21614	25 %	25 %	25 %	25 %	381335648
270	NC_016821	CAGCT	2	10	21633	21642	20 %	20 %	20 %	40 %	381335648
271	NC_016821	CAA	2	6	21774	21779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335648
272	NC_016821	CAT	2	6	21873	21878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
273	NC_016821	CCAT	2	8	21889	21896	25 %	25 %	0 %	50 %	381335648
274	NC_016821	CTG	2	6	21908	21913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335648
275	NC_016821	CTT	2	6	21917	21922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335648
276	NC_016821	ACC	2	6	21975	21980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	381335648
277	NC_016821	ATG	2	6	21981	21986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335648
278	NC_016821	CAT	2	6	22076	22081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335648
279	NC_016821	AGCT	2	8	22085	22092	25 %	25 %	25 %	25 %	381335648
280	NC_016821	CACC	2	8	22112	22119	25 %	0 %	0 %	75 %	381335648
281	NC_016821	AT	3	6	22189	22194	50 %	50 %	0 %	0 %	381335649
282	NC_016821	GACA	2	8	22226	22233	50 %	0 %	25 %	25 %	381335649
283	NC_016821	GCA	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335649
284	NC_016821	TGC	2	6	22262	22267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335649
285	NC_016821	AAT	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335649
286	NC_016821	GTA	2	6	22332	22337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335649
287	NC_016821	CTT	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	381335649
288	NC_016821	ACA	2	6	22447	22452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
289	NC_016821	CGC	2	6	22460	22465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381335649
290	NC_016821	AGC	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335649
291	NC_016821	AATC	2	8	22540	22547	50 %	25 %	0 %	25 %	381335649
292	NC_016821	AAT	2	6	22595	22600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335649
293	NC_016821	ATATT	2	10	22605	22614	40 %	60 %	0 %	0 %	381335649
294	NC_016821	T	7	7	22613	22619	0 %	100 %	0 %	0 %	381335649
295	NC_016821	AATG	2	8	22624	22631	50 %	25 %	25 %	0 %	381335649
296	NC_016821	TTG	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381335649
297	NC_016821	CAA	2	6	22709	22714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
298	NC_016821	CAA	2	6	22780	22785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335649
299	NC_016821	CAT	2	6	22882	22887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335649
300	NC_016821	AC	3	6	22893	22898	50 %	0 %	0 %	50 %	381335649
301	NC_016821	GCT	2	6	22932	22937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335649
302	NC_016821	TTGG	2	8	22943	22950	0 %	50 %	50 %	0 %	381335649
303	NC_016821	ATT	2	6	23084	23089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
304	NC_016821	GTC	2	6	23101	23106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335650
305	NC_016821	AGC	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381335650
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307	NC_016821	ATT	2	6	23229	23234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
308	NC_016821	AAC	2	6	23236	23241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	381335650
309	NC_016821	GCTG	2	8	23448	23455	0 %	25 %	50 %	25 %	381335650
310	NC_016821	GATT	2	8	23475	23482	25 %	50 %	25 %	0 %	381335650
311	NC_016821	AAT	2	6	23543	23548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381335650
312	NC_016821	GAT	2	6	23552	23557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381335650
313	NC_016821	TAT	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381335650
314	NC_016821	CATACT	2	12	23687	23698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381335650
315	NC_016821	CGC	2	6	23699	23704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	381335650
316	NC_016821	TAAA	2	8	23733	23740	75 %	25 %	0 %	0 %	381335650
317	NC_016821	CATAC	2	10	23838	23847	40 %	20 %	0 %	40 %	381335650
318	NC_016821	GTC	2	6	24019	24024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381335650

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.